西南醫(yī)院坐落于兩江環(huán)抱、山水相依的重慶市沙坪壩區(qū)高灘巖上，有著悠久的歷史和光榮的傳統(tǒng)。醫(yī)院前身系國民政府中央醫(yī)院，1929年建于南京，1941年遷至重慶，1950年正式命名，現(xiàn)為第三軍醫(yī)大學第一附屬醫(yī)院、西南臨床醫(yī)學院。經(jīng)過80多年的建設發(fā)展，業(yè)已成為一所集醫(yī)、教、研于一體的大型綜合性現(xiàn)代化“三級甲等”醫(yī)院。醫(yī)院占地面積300余畝，建筑面積36萬平方米，展開床位2900余張，儀器設備總值15億元，擁有達芬奇手術機器人、PET/CT、3.0MRI、雙源螺旋CT、ECT、腦磁圖、大型高壓氧艙群、神經(jīng)導航系統(tǒng)等一系列高精尖診療設備。2016年門急診量382萬人次、收容量13.2萬人次、手術量9.6萬臺次，醫(yī)教研護工作協(xié)調發(fā)展，辦院綜合實力國內一流。

學科優(yōu)勢明顯。擁有國家重點學科10個(燒傷科、肝膽外科、感染病科、泌尿外科、神經(jīng)外科、骨科、胸心外科、整形外科、心血管內科、呼吸內科)，國家重點培育學科2個(消化內科、眼科)；國家中醫(yī)藥管理局重點學科1個(中西醫(yī)結合科)，全軍醫(yī)學研究所7個(燒傷科、肝膽外科、感染病科、泌尿外科、消化內科、神經(jīng)外科、病理科)，全軍醫(yī)學?？?、專病中心7個(骨科、眼科、普通外科、檢驗科、婦產科、心血管內科、康復理療科)，全軍衛(wèi)生信息基地1個，國家重點實驗室2個，“組織工程國家地方聯(lián)合工程實驗室”1個。臨床醫(yī)學一級學科均為博士學位授權學科及重慶市重點學科。

人才實力雄厚。先后產生工程院院士2名，現(xiàn)有重慶市醫(yī)口惟一的中國科學院院士1名，院士后備人選2名。有各類專業(yè)技術人員5000余人，其中高級職稱455名，享受政府特殊津貼專家44名，“973”首席科學家4名，長江學者1名，國家杰出青年基金獲得者4名，博士、碩士生導師209人。

醫(yī)療特色突出。形成了創(chuàng)(燒)傷、消化系疾病(肝病)、心腦血管病、感染病、泌尿系疾病、眼病、腫瘤綜合診治、康復整形等八大臨床優(yōu)勢領域；培育了乳腺、關節(jié)、風濕病、眼底病、前列腺疾病、疼痛治療、心理治療、優(yōu)生優(yōu)育等八大臨床專病特色；鍛造了大器官移植(心、肝、腎、多器官聯(lián)合)、全系列微創(chuàng)外科(各系統(tǒng)腹腔鏡、介入、內鏡、射頻)、危急重癥救治、組織工程修復、基因診斷治療等五大臨床核心技術。

科技創(chuàng)新活躍。先后獲得國家科技進步一等獎3項、二等獎16項，軍隊（省部級）科技進步（醫(yī)療成果）一等獎35項、二等獎146項。承擔省部級以上課題1200余項，其中“973”、“863”等國家重大、重點項目62余項，獲科研經(jīng)費5.8億元。在國外SCI收錄雜志發(fā)表論文900余篇，最高單篇影響因子53.3。2013年度專利數(shù)量居全國醫(yī)療機構第一位。

醫(yī)院始終堅持姓軍為兵、姓軍為戰(zhàn)的辦院方向，秉承“做行業(yè)典范、建一流名院”的建院理念，按照“適度規(guī)模、內涵建設、創(chuàng)新發(fā)展，以質量特色取勝”的發(fā)展思路，努力建設“躋身世界一流名院方陣的研究型醫(yī)院”。

2002年，在國內較早通過英國皇家標準協(xié)會(BSI)的IS09001質量管理體系認證；

2003年，建成9.7萬平方米的外科大樓；

2006年，建成設施完備、功能齊全的臨床技能模擬培訓中心；

2007年，建成7.6萬平方米、能夠同時容納一萬人就診、集現(xiàn)代化智能化人性化生態(tài)化于一體的新門急診大樓，獲評全國“首批數(shù)字化試點示范醫(yī)院”；

2010年，通過國際SIDCER倫理認證；

2012年，獲評首批研究型醫(yī)院建設試點醫(yī)院；

2014年，獲評軍隊研究型醫(yī)院建設示范單位。

先后獲全國百姓放心百佳示范醫(yī)院、全國優(yōu)質服務百佳醫(yī)院、全國醫(yī)院文化建設先進單位、全國精神文明建設先進單位、全軍先進醫(yī)院、全軍為部隊服務先進單位、總后先進師旅團級黨委、重慶市民看病首選醫(yī)院等殊榮。