腸道菌群失調的檢查，主要是實驗室檢查，進行菌群分析為主要的檢查方法，包括定性分析和定量分析，通過菌群分析檢查出菌群比例失調，有助于診斷，細菌培養(yǎng)培養(yǎng)出致病菌的病原體，也可以明確病因。結腸鏡檢查可見腸黏膜出現彌漫性充血，水腫、血管分支模糊不清或者消失，有散在的糜爛、潰瘍以及出血、有時可見黃色假膜附著。