腸道菌群分析是指通過檢測糞便樣本中微生物的組成和功能,評估腸道內(nèi)細(xì)菌、真菌等微生物群落結(jié)構(gòu)的技術(shù)。腸道菌群宏基因測序是對腸道微生物全部基因進(jìn)行高通量測序的方法,能夠全面解析菌群基因功能。
腸道菌群分析主要采用16S rRNA基因測序技術(shù),通過擴(kuò)增細(xì)菌特有的16S rRNA基因可變區(qū),鑒定不同微生物的種類和豐度。該方法可識別腸道中厚壁菌門、擬桿菌門等主要菌群比例,評估腸道微生態(tài)平衡狀態(tài)。臨床常用于診斷腸道菌群失調(diào)、艱難梭菌感染等疾病,也可輔助評估抗生素使用后菌群恢復(fù)情況。采樣時需使用專用保存管收集新鮮糞便,避免樣本降解影響結(jié)果準(zhǔn)確性。
腸道菌群宏基因測序采用全基因組鳥槍法測序技術(shù),無需培養(yǎng)即可獲得微生物群落的全部基因信息。相比16S測序,該方法能更精確識別菌種亞型,同時解析微生物的代謝通路、耐藥基因等功能特征。在研究中可用于探索腸道菌群與肥胖、糖尿病等慢性病的關(guān)聯(lián)機(jī)制,臨床適用于復(fù)雜腸道感染病原體篩查或功能性胃腸病機(jī)制研究。檢測需專業(yè)生物信息學(xué)分析,成本較高但數(shù)據(jù)維度更豐富。
進(jìn)行腸道菌群檢測前3天需保持正常飲食,避免劇烈改變飲食習(xí)慣。采樣前24小時停用益生菌、抗生素等可能干擾結(jié)果的藥物。檢測后可根據(jù)結(jié)果調(diào)整膳食纖維攝入,或遵醫(yī)囑補(bǔ)充特定益生菌株。長期腸道不適或既往有炎癥性腸病史者,建議結(jié)合腸鏡等檢查綜合評估。
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